Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ZNF608Q9ULD9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ZNF608Q9ULD9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ZNF608Q9ULD9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms