Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PACSIN3Q9UKS6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms