Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MRTO4Q9UKD2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MRTO4Q9UKD2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms