Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms