Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3BQ9UH17 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms