Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGXB4Q9UGU5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms