Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJB4Q9UDY4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJB4Q9UDY4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms