Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NKX1-2Q9UD57 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NKX1-2Q9UD57 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms