Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM8A1Q9UBU6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM8A1Q9UBU6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM8A1Q9UBU6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms