Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPRR3Q9UBC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPRR3Q9UBC9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms