Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP35Q9P2H5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP35Q9P2H5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
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