Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms