Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC88CQ9P219 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms