Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC45.61■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC45.58■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
CCDC180Q9P1Z9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC45.56■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC45.53■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC45.51■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.51■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC45.51■■■■■ 4.88
CCDC180Q9P1Z9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC45.45■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC45.45■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC45.45■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC45.44■■■■■ 4.87
CCDC180Q9P1Z9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms