Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HMG20BQ9P0W2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMG20BQ9P0W2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms