Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKIPSDQ9NZQ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKIPSDQ9NZQ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms