Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DLL3Q9NYJ7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DLL3Q9NYJ7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms