Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COA4Q9NYJ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms