Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLCO1C1Q9NYB5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms