Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPD3Q9NY59 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPD3Q9NY59 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 964.5 ms