Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPP4R2Q9NY27 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP4R2Q9NY27 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms