Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGPEP1Q9NXJ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGPEP1Q9NXJ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms