Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD8Q9NX08 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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