Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A7Q9NVC3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A7Q9NVC3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A7Q9NVC3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms