Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCF3Q9NUQ8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms