Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARHGAP35Q9NRY4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ARHGAP35Q9NRY4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARHGAP35Q9NRY4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms