Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBQLN4Q9NRR5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms