Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRAC1Q9NRG0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRAC1Q9NRG0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms