Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C8orf4Q9NR00 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms