Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC3Q9NQT5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC3Q9NQT5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms