Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL2

RRAGD, Ras-related GTP-binding protein D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGDQ9NQL2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRAGDQ9NQL2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRAGDQ9NQL2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRAGDQ9NQL2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRAGDQ9NQL2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRAGDQ9NQL2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRAGDQ9NQL2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRAGDQ9NQL2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms