Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DNAJC4Q9NNZ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DNAJC4Q9NNZ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms