Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD248Q9HCU0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD248Q9HCU0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms