Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNCQ9H7C4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNCQ9H7C4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNCQ9H7C4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms