Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
WDR55Q9H6Y2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms