Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHX3Q9H6B9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHX3Q9H6B9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms