Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RABEP2Q9H5N1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABEP2Q9H5N1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms