Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNMDQ9H2S6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNMDQ9H2S6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms