Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EHD4Q9H223 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EHD4Q9H223 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
EHD4Q9H223 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms