Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC8Q9H0W5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC8Q9H0W5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC8Q9H0W5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms