Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM49AQ9H0Q0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM49AQ9H0Q0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM49AQ9H0Q0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms