Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SHARPINQ9H0F6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHARPINQ9H0F6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms