Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD1Q9GZZ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms