Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC90BQ9GZT6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC90BQ9GZT6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms