Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REXO4Q9GZR2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms