Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDGFDQ9GZP0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDGFDQ9GZP0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms