Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC39A8Q9C0K1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC39A8Q9C0K1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC39A8Q9C0K1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms