Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC27Q9C0I9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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LRRC27Q9C0I9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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