Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRCC1Q9C099 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRCC1Q9C099 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 905.6 ms