Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM9Q9C026 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM9Q9C026 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms